xmipp3.protocols package
Subpackages
- xmipp3.protocols.protocol_preprocess package
- Submodules
- xmipp3.protocols.protocol_preprocess.geometrical_mask module
- xmipp3.protocols.protocol_preprocess.protocol_add_noise module
- xmipp3.protocols.protocol_preprocess.protocol_create_mask2d module
- xmipp3.protocols.protocol_preprocess.protocol_create_mask3d module
- xmipp3.protocols.protocol_preprocess.protocol_crop_resize module
- xmipp3.protocols.protocol_preprocess.protocol_filter module
- xmipp3.protocols.protocol_preprocess.protocol_image_operate module
- xmipp3.protocols.protocol_preprocess.protocol_mask module
- xmipp3.protocols.protocol_preprocess.protocol_movie_resize module
- xmipp3.protocols.protocol_preprocess.protocol_preprocess module
- xmipp3.protocols.protocol_preprocess.protocol_process module
- Module contents
- Submodules
- xmipp3.protocols.protocol_projmatch package
Submodules
- xmipp3.protocols.protocol_align_volume module
- xmipp3.protocols.protocol_align_volume_and_particles module
- xmipp3.protocols.protocol_analyze_local_ctf module
- xmipp3.protocols.protocol_angular_graph_consistency module
- xmipp3.protocols.protocol_angular_resolution_alignment module
- xmipp3.protocols.protocol_apply_alignment module
- xmipp3.protocols.protocol_apply_transformation_matrix module
- xmipp3.protocols.protocol_apply_zernike3d module
- xmipp3.protocols.protocol_assignment_tilt_pair module
- xmipp3.protocols.protocol_break_symmetry module
- xmipp3.protocols.protocol_center_particles module
- xmipp3.protocols.protocol_cl2d module
- xmipp3.protocols.protocol_cl2d_align module
- xmipp3.protocols.protocol_classes_2d_mapping module
- xmipp3.protocols.protocol_compare_angles module
- xmipp3.protocols.protocol_compare_reprojections module
- xmipp3.protocols.protocol_consensus_classes module
- xmipp3.protocols.protocol_consensus_local_ctf module
- xmipp3.protocols.protocol_convert_pdb module
- xmipp3.protocols.protocol_core_analysis module
- xmipp3.protocols.protocol_create_gallery module
- xmipp3.protocols.protocol_ctf_consensus module
- xmipp3.protocols.protocol_ctf_correct_wiener2d module
- xmipp3.protocols.protocol_ctf_defocus_group module
- xmipp3.protocols.protocol_ctf_micrographs module
- xmipp3.protocols.protocol_deep_center module
- xmipp3.protocols.protocol_deep_hand module
- xmipp3.protocols.protocol_deep_micrograph_screen module
- xmipp3.protocols.protocol_denoise_particles module
- xmipp3.protocols.protocol_eliminate_empty_images module
- xmipp3.protocols.protocol_enrich module
- xmipp3.protocols.protocol_extract_asymmetric_unit module
- xmipp3.protocols.protocol_extract_particles module
- xmipp3.protocols.protocol_extract_particles_movies module
- xmipp3.protocols.protocol_extract_particles_pairs module
- xmipp3.protocols.protocol_flexalign module
- xmipp3.protocols.protocol_generate_reprojections module
- xmipp3.protocols.protocol_helical_parameters module
- xmipp3.protocols.protocol_kerdensom module
- xmipp3.protocols.protocol_local_ctf module
- xmipp3.protocols.protocol_ml2d module
- xmipp3.protocols.protocol_movie_dose_analysis module
- xmipp3.protocols.protocol_movie_gain module
- xmipp3.protocols.protocol_movie_max_shift module
- xmipp3.protocols.protocol_movie_opticalflow module
- xmipp3.protocols.protocol_movie_split_frames module
- xmipp3.protocols.protocol_multiple_fscs module
- xmipp3.protocols.protocol_multireference_alignability module
- xmipp3.protocols.protocol_normalize_strain module
- xmipp3.protocols.protocol_particle_pick module
- xmipp3.protocols.protocol_particle_pick_automatic module
- xmipp3.protocols.protocol_particle_pick_consensus module
- xmipp3.protocols.protocol_particle_pick_pairs module
- xmipp3.protocols.protocol_particle_pick_remove_duplicates module
- xmipp3.protocols.protocol_phantom_create module
- xmipp3.protocols.protocol_pick_noise module
- xmipp3.protocols.protocol_postProcessing_deepPostProcessing module
- xmipp3.protocols.protocol_preprocess_micrographs module
- xmipp3.protocols.protocol_random_conical_tilt module
- xmipp3.protocols.protocol_ransac module
- xmipp3.protocols.protocol_reconstruct_fourier module
- xmipp3.protocols.protocol_reconstruct_highres module
- xmipp3.protocols.protocol_reconstruct_significant module
- xmipp3.protocols.protocol_reconstruct_swarm module
- xmipp3.protocols.protocol_resolution3d module
- xmipp3.protocols.protocol_resolution_bfactor module
- xmipp3.protocols.protocol_resolution_deepres module
- xmipp3.protocols.protocol_resolution_directional module
- xmipp3.protocols.protocol_resolution_fso module
- xmipp3.protocols.protocol_resolution_monogenic_signal module
- xmipp3.protocols.protocol_rotate_volume module
- xmipp3.protocols.protocol_rotational_symmetry module
- xmipp3.protocols.protocol_screen_deepConsensus module
- xmipp3.protocols.protocol_screen_deeplearning module
- xmipp3.protocols.protocol_screen_particles module
- xmipp3.protocols.protocol_shift_particles module
- xmipp3.protocols.protocol_shift_volume module
- xmipp3.protocols.protocol_simulate_ctf module
- xmipp3.protocols.protocol_structure_map module
- xmipp3.protocols.protocol_structure_map_zernike3d module
- xmipp3.protocols.protocol_subtract_projection module
- xmipp3.protocols.protocol_tilt_analysis module
- xmipp3.protocols.protocol_trigger_data module
- xmipp3.protocols.protocol_validate_fscq module
- xmipp3.protocols.protocol_validate_nontilt module
- xmipp3.protocols.protocol_validate_overfitting module
- xmipp3.protocols.protocol_volume_adjust_sub module
- xmipp3.protocols.protocol_volume_consensus module
- xmipp3.protocols.protocol_volume_deform_zernike3d module
- xmipp3.protocols.protocol_volume_local_adjust module
- xmipp3.protocols.protocol_volume_local_sharpening module
- xmipp3.protocols.protocol_volume_strain module
- xmipp3.protocols.protocol_write_testC module
- xmipp3.protocols.protocol_write_testP module