pyworkflow package

Subpackages

• pyworkflow.apps package
  • Submodules
    • pyworkflow.apps.pw_chimera_client module
    • pyworkflow.apps.pw_chimera_virus module
    • pyworkflow.apps.pw_config module
    • pyworkflow.apps.pw_convert module
    • pyworkflow.apps.pw_manager module
    • pyworkflow.apps.pw_plot module
    • pyworkflow.apps.pw_program module
    • pyworkflow.apps.pw_project module
    • pyworkflow.apps.pw_protocol_list module
    • pyworkflow.apps.pw_protocol_mpirun module
    • pyworkflow.apps.pw_protocol_remote module
    • pyworkflow.apps.pw_protocol_run module
    • pyworkflow.apps.pw_run_tests module
    • pyworkflow.apps.pw_schedule_run module
    • pyworkflow.apps.pw_sleep module
    • pyworkflow.apps.pw_sync_data module
    • pyworkflow.apps.pw_tutorial module
    • pyworkflow.apps.pw_viewer module
  • Module contents
• pyworkflow.em package
  • Subpackages
    • pyworkflow.em.convert package
      • Submodules
        • pyworkflow.em.convert.atom_struct module
        • pyworkflow.em.convert.headers module
        • pyworkflow.em.convert.image_handler module
        • pyworkflow.em.convert.sequence module
        • pyworkflow.em.convert.symmetry module
        • pyworkflow.em.convert.transformations module
        • pyworkflow.em.convert.utils module
      • Module contents
    • pyworkflow.em.metadata package
      • Submodules
        • pyworkflow.em.metadata.classes module
        • pyworkflow.em.metadata.constants module
        • pyworkflow.em.metadata.functions module
        • pyworkflow.em.metadata.utils module
      • Module contents
    • pyworkflow.em.protocol package
      • Subpackages
        • pyworkflow.em.protocol.monitors package
          • Submodules
            • pyworkflow.em.protocol.monitors.getnifs module
            • pyworkflow.em.protocol.monitors.protocol_monitor module
            • pyworkflow.em.protocol.monitors.protocol_monitor_2d_streamer module
            • pyworkflow.em.protocol.monitors.protocol_monitor_ctf module
            • pyworkflow.em.protocol.monitors.protocol_monitor_movie_gain module
            • pyworkflow.em.protocol.monitors.protocol_monitor_summary module
            • pyworkflow.em.protocol.monitors.protocol_monitor_system module
            • pyworkflow.em.protocol.monitors.pynvml module
            • pyworkflow.em.protocol.monitors.report_html module
            • pyworkflow.em.protocol.monitors.summary_provider module
          • Module contents
        • pyworkflow.em.protocol.protocol_export package
          • Submodules
            • pyworkflow.em.protocol.protocol_export.protocol_export_emdb module
          • Module contents
        • pyworkflow.em.protocol.protocol_import package
          • Submodules
            • pyworkflow.em.protocol.protocol_import.base module
            • pyworkflow.em.protocol.protocol_import.coordinates module
            • pyworkflow.em.protocol.protocol_import.ctfs module
            • pyworkflow.em.protocol.protocol_import.dataimport module
            • pyworkflow.em.protocol.protocol_import.images module
            • pyworkflow.em.protocol.protocol_import.masks module
            • pyworkflow.em.protocol.protocol_import.micrographs module
            • pyworkflow.em.protocol.protocol_import.particles module
            • pyworkflow.em.protocol.protocol_import.sequence module
            • pyworkflow.em.protocol.protocol_import.volumes module
          • Module contents
      • Submodules
        • pyworkflow.em.protocol.parallel module
        • pyworkflow.em.protocol.protocol module
        • pyworkflow.em.protocol.protocol_2d module
        • pyworkflow.em.protocol.protocol_3d module
        • pyworkflow.em.protocol.protocol_align_movies module
        • pyworkflow.em.protocol.protocol_alignment_assign module
        • pyworkflow.em.protocol.protocol_batch module
        • pyworkflow.em.protocol.protocol_classes_consensus module
        • pyworkflow.em.protocol.protocol_create_stream_data module
        • pyworkflow.em.protocol.protocol_ctf_assign module
        • pyworkflow.em.protocol.protocol_extract_coordinates module
        • pyworkflow.em.protocol.protocol_micrographs module
        • pyworkflow.em.protocol.protocol_movies module
        • pyworkflow.em.protocol.protocol_particles module
        • pyworkflow.em.protocol.protocol_particles_picking module
        • pyworkflow.em.protocol.protocol_pdf_report module
        • pyworkflow.em.protocol.protocol_sets module
        • pyworkflow.em.protocol.protocol_tests module
        • pyworkflow.em.protocol.protocol_tiltpairs module
      • Module contents
    • pyworkflow.em.viewers package
      • Submodules
        • pyworkflow.em.viewers.chimera_server module
        • pyworkflow.em.viewers.plotter module
        • pyworkflow.em.viewers.showj module
        • pyworkflow.em.viewers.viewer_chimera module
        • pyworkflow.em.viewers.viewer_fsc module
        • pyworkflow.em.viewers.viewer_localres module
        • pyworkflow.em.viewers.viewer_monitors module
        • pyworkflow.em.viewers.viewer_pdf module
        • pyworkflow.em.viewers.viewer_sequence module
        • pyworkflow.em.viewers.viewer_vmd module
        • pyworkflow.em.viewers.viewer_volumes module
        • pyworkflow.em.viewers.viewers_data module
        • pyworkflow.em.viewers.viewers_protocols module
        • pyworkflow.em.viewers.views module
      • Module contents
  • Submodules
    • pyworkflow.em.constants module
    • pyworkflow.em.data module
    • pyworkflow.em.data_tiltpairs module
    • pyworkflow.em.wizard module
    • pyworkflow.em.wizards module
  • Module contents
• pyworkflow.gui package
  • Subpackages
    • pyworkflow.gui.project package
      • Submodules
        • pyworkflow.gui.project.base module
        • pyworkflow.gui.project.constants module
        • pyworkflow.gui.project.labels module
        • pyworkflow.gui.project.project module
        • pyworkflow.gui.project.utils module
        • pyworkflow.gui.project.viewdata module
        • pyworkflow.gui.project.viewprojects module
        • pyworkflow.gui.project.viewprotocols module
      • Module contents
  • Submodules
    • pyworkflow.gui.browser module
    • pyworkflow.gui.canvas module
    • pyworkflow.gui.dialog module
    • pyworkflow.gui.form module
    • pyworkflow.gui.graph module
    • pyworkflow.gui.graph_layout module
    • pyworkflow.gui.gui module
    • pyworkflow.gui.matplotlib_image module
    • pyworkflow.gui.plotter module
    • pyworkflow.gui.plugin_manager module
    • pyworkflow.gui.text module
    • pyworkflow.gui.tooltip module
    • pyworkflow.gui.tree module
    • pyworkflow.gui.widgets module
  • Module contents
• pyworkflow.install package
  • Submodules
    • pyworkflow.install.change_rpath module
    • pyworkflow.install.clean module
    • pyworkflow.install.find_deps module
    • pyworkflow.install.funcs module
    • pyworkflow.install.get-pip module
    • pyworkflow.install.inspect-plugins module
    • pyworkflow.install.install-plugin module
    • pyworkflow.install.plugin_funcs module
    • pyworkflow.install.script module
    • pyworkflow.install.tar module
    • pyworkflow.install.upgrade_release module
  • Module contents
• pyworkflow.mapper package
  • Submodules
    • pyworkflow.mapper.mapper module
    • pyworkflow.mapper.postgresql module
    • pyworkflow.mapper.sqlite module
    • pyworkflow.mapper.sqlite_db module
    • pyworkflow.mapper.xmlmapper module
  • Module contents
• pyworkflow.project package
  • Submodules
    • pyworkflow.project.config module
    • pyworkflow.project.manager module
    • pyworkflow.project.project module
  • Module contents
• pyworkflow.protocol package
  • Submodules
    • pyworkflow.protocol.bibtex module
    • pyworkflow.protocol.constants module
    • pyworkflow.protocol.executor module
    • pyworkflow.protocol.hosts module
    • pyworkflow.protocol.launch module
    • pyworkflow.protocol.package module
    • pyworkflow.protocol.params module
    • pyworkflow.protocol.protocol module
    • pyworkflow.protocol.scipion module
  • Module contents
• pyworkflow.utils package
  • Submodules
    • pyworkflow.utils.dataset module
    • pyworkflow.utils.echo module
    • pyworkflow.utils.file_transfer module
    • pyworkflow.utils.graph module
    • pyworkflow.utils.log module
    • pyworkflow.utils.mpi module
    • pyworkflow.utils.path module
    • pyworkflow.utils.process module
    • pyworkflow.utils.profiler module
    • pyworkflow.utils.properties module
    • pyworkflow.utils.reflection module
    • pyworkflow.utils.remote module
    • pyworkflow.utils.utils module
    • pyworkflow.utils.which module
  • Module contents
• pyworkflow.webservices package
  • Submodules
    • pyworkflow.webservices.config module
    • pyworkflow.webservices.notifier module
    • pyworkflow.webservices.repository module
  • Module contents

Submodules

• pyworkflow.object module
• pyworkflow.plugin module
• pyworkflow.viewer module
• pyworkflow.wizard module

Module contents

members

undoc-members

show-inheritance